cPanel kullanan internet siteleri serverda yaptıkları değişiklikleri aktif etmek yada çalışmayan eklentileri çalışır hale getirebilmek için sunucunun bazı bölümlerini yeniden başlatma ihtiyacı duyabilirsiniz. SSH kullanarak sunucunuzun Apache, cPanel, MySQL, DNS (BIND), Exim (mail), FTP servislerini yeniden başlatabilirsiniz. Tabi bunu yapabilmek için ilk olarak bir SSH programına ihtiyacınız var. Bunun için ücretsiz bir çok program yer almaktadır. Hızlıca bağlanıp aşağıdaki komutları kullanarak ilgili bölümü yeniden başlatabilirsiniz.
Cpanel Servislerini Yeniden Başlatma
Apache yeniden başlatma: /scripts/restartsrv httpd
cPanel yeniden başlatma: /etc/rc.d/init.d/cpanel restart
MySQL Servisini yeniden başlatma: /scripts/restartsrv mysql
DNS (BIND) Resetleme: /scripts/restartsrv named
Exim(mail) Resetleme: /scripts/restartsrv exim
FTP Resetleme: service xinetd restart